Вечером 1 мая 1945 всесильного шефа Гестапо видели в последний раз. Несколько очевидцев подтвердили, что он в тот день отказался присоединиться к группе офицеров, планировавших ночной побег из окруженного Берлина на запад. По воспоминаниям личного пилота Гитлера Ганса Бауэра, который дружил с Мюллером еще с Первой Мировой войны, Мюллер был готов попасть куда угодно, но только не в плен к русским. И действительно, большая часть той группы офицеров была пленена советскими войсками, тот же Бауэр 10 лет отсидел в СССР.

В августе 1945 у Имперского министерства авиации было найдено тело в генеральской форме с документами Мюллера, поэтому все считали Мюллера погибшим. Кое какие подозрения остались, поэтому в 1963 тело было эксгумировано, и выяснилось, что Мюллеру они принадлежать не могут...

Мог ли он скрыться в Аргентине? Безусловно, у шефа Гестапо для это были все необходимые связи и навыки. Даже доктор-изувер Йозеф Менгеле, сумел скрыться в Аргентине и помереть там от старости.

Грегори Дуглас утверждал, что Мюллер живет в США, его допрашивали, он работает на ЦРУ. Один из офицеров Вермахта видел Мюллера в советском плену.